熱力学– category –

MDでは通常の運動方程式（$ma=F$）に従うだけでは、温度一定のシミュレーションはできません。 このページではMDでよく用いられる能勢・フーバー法（NVT一定）のアルゴリズムを確認し、実際に単原子分子に対して分子動力学シミュレーションを行った結果を...

水分子などの分子動力学シミュレーション（MD）はヘリウムなどの単原子分子に比べてアルゴリズムの難易度が上がります。 しかし、MDでは水分子やタンパク質といった「形」があるもののシミュレーションのほうが単原子状分子のものよりも圧倒的に多いでしょ...

分子動力学シミュレーション（MD）は化学のシミュレーションの中でもかなりメジャーな方法です。タンパク質のダイナミックな動きをシミュレーションしたMDを見た方も多いのではないでしょうか？ MDは古典力学に則るだけと思われがちですが、精度よくシミュ...

エントロピーという言葉を聞いたことがない方はほとんどいないと思いますが、具体的なイメージが湧きににくいと感じる方が多いのではないでしょうか？ 熱力学を得意になるために重要になってくるのが「どれだけ具体的数値に落とし込んで熱力学を理解したか...

エントロピーという言葉を聞いたことがない方はほとんどいないと思います。しかし、$\text{d}S=\text{d}Q/T$や$\Delta{S}=C_v\ln\frac{T_1}{T_2}$などの数式が多く、具体的なイメージが湧きににくいと感じる方が多いのではないでしょうか？ 熱力学を得意に...